BEGIN:VCALENDAR
VERSION:2.0
PRODID:-//University of Iceland//AI Centre//EN
CALSCALE:GREGORIAN
METHOD:PUBLISH
BEGIN:VEVENT
UID:ff55970f-fdab-4a26-b484-c9f7b51a6765@ai.hi.is
DTSTAMP:20261025T064513Z
DTSTART:20260915T090000Z
DTEND:20260915T100000Z
SUMMARY:Íslenskt erfðamengisviðmið
DESCRIPTION:Guillaume Holley og Hannes Pétur Eggertsson kynna grein þeirr
 a: An Icelandic pangenome reference\, sem birtist nýverið í Nature.\n\n
 \nViðmiðunarskekkja (reference bias) er vandamál sem hefur áhrif á fl
 estar erfðamengisrannsóknir þar sem stuttum raðlesningum er varpað á
  viðmiðunarerfðamengi. Hægt er að draga úr henni með því að varp
 a á margar haplótýpur sem koma fram í safnerfðamengi (pangenome). Hé
 r kynnum við tvær nýjar aðferðir til að takast á við viðmiðunars
 kekkju: Emblask til að byggja safnerfðamengi og Weaver til að varpa á 
 safnerfðamengi í stórum stíl. Emblask er blandað vinnsluferli fyrir t
 víþætta samsetningu með aðgreindum haplótýpum\, byggt á bæði lö
 ngum og stuttum raðlesningum og ætlað þríeykisgögnum foreldra og afk
 væmis. Með Emblask settum við saman 698 íslenskar haplótýpur og bæt
 tum þeim við safnerfðamengi Human Pangenome Reference Consortium (HPRC)
  til að smíða íslenskt viðmiðunar-safnerfðamengi (HPRC-ICE) sem inn
 iheldur 51\,41 milljón smábreytileika. Við vörpuðum stuttum raðlesni
 ngum 57.630 Íslendinga á HPRC-ICE með Weaver og greindum 98\,96 milljó
 nir breytileika\, sem er 6\,17% aukning miðað við vörpun á línulegt 
 viðmiðunarerfðamengi. Við fundum nýja breytileika á svæðum með l
 ága vörpunarhæfni\, þar á meðal meinvaldandi einbasabreytileika (SNP
 ) í GBA1 sem tengist snemmkomnum Parkinsonssjúkdómi og missense-breytil
 eika í CBS sem er meinvaldandi fyrir hómócystínmigu. Við endurtókum 
 tengsl GBA1 í UK Biobank með markvissri endurvörpun 429.193 breskra og 
 írskra þátttakenda.\n\nhttps://ai.hi.is/is/events/an-icelandic-pangenom
 e-reference/
LOCATION:Íslensk erfðagreining\, Tjarnarsalur
URL:https://ai.hi.is/is/events/an-icelandic-pangenome-reference/
STATUS:CONFIRMED
END:VEVENT
END:VCALENDAR
